【2021暑期】COVID-19解读与分析生信大数据实践定制科研项目 爱博物    2021年暑期


    【项目介绍】

      新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)是指 2019新型冠状病毒 感染导致的肺炎。截止2020年11月1日,全球累计确诊4678万例。新型冠状病毒可引起严重的呼吸系统疾病,在部分严重病例中可导致死亡。目前已有多篇相关论文快速发表,有效的支撑了疫情防控工作。

      长期以来,DNA测序技术,作为将微观生物分子信息转换成可处理的电子信息的方式,一直是分子生物学相关研究中最常用的技术手段之一,从一定程度上推动了该领域的快速发展。每一代测序技术的更替都标志着生物学中基因芯片、数据分析、表面化学、生物工程等技术领域有了新的突破,从而应用在了测序领域,大大降低了测序成本,提高了测序效率,使测序向着高通量、低成本、高安全性和商业化的方向发展。

      病毒序列研究最基础的就是病毒序列的鉴定,特别是当一种传染性病毒爆发的时候,如何有效的鉴定出病毒的序列以及基于已鉴定出的病毒序列去鉴定区分被感染和健康人群,是传染性疾病防控的关键步骤。本项目将介绍二代测序数据如何应用于新冠病毒的鉴定,以及基于病毒序列计算病毒载量。同时通过鉴定样本中其他病原微生物对序列探讨是否存在共感染现象以及通过构建系统进化树,进而分析病毒的地域性分布,探讨其起源,传播等。

      项目将介绍基于二代测序数据标准分析的步骤及原理,包括数据的产出方式和格式、数据质控、分析步骤原理和实操(比对、变异检测等),使同学们具备基本的生信分析技能,从而更好地开展接下来针对病毒相关的研究。

      通过参与该项目,学生不仅可以学习到生物信息学相关的前沿知识,同时可以在金鑫导师团队的带领下,参与进正在进行的COVID-19新冠疫情相关的科研课题之中,运用基因数据分析方法完成科研内容,深度参与到真实科研项目中。对学员学术背景起到强有力的提升。

      【项目时间】2021年暑期(本项目为vip定制专属,具体时间根据学员和导师实际情况设定时间)

      【推荐年级】9年级以上

      【项目地点】中国·深圳国家基因库

      国家基因库是服务于国家战略的国家级公益性创新科研及产业基础设施建设项目,也是我国首个获批筹建的国家级综合性基因库,以对生物资源的存、读、写能力为基础,搭建起基因资源挖掘的公益性、开放性、支撑性、引领性服务平台,将建设成为引领我国生命科学和生物经济发展的战略性科技力量。

      

      ▲国家基因库

      【领衔导师】

      金鑫

      华大基因青年科学家,基因组学与生物信息学专家。曾参与一系列重大科研项目的攻坚,包括国际千人基因组计划、人类泛基因组图谱计划等。专注于基因大数据的挖掘,以及基因组学的医学应用研发与实践。已在《Cell》《Nature》《Science》《PNAS》等国际顶级学术杂志发表论文三十余篇。

      查老师:13910312020(微信同号)

      极萨学院™是中国第一所由民间力量发起的少年科学院,由国内知名的青少年科学研究及学术项目提供平台爱博物发起,旨在为中国青少年提供高质量的科学实践平台。

      爱博物先后获得了华大基因、好未来教育产业基金的投资,凭借强大的科学与资本背景,极萨学院结集了全球数十位多学科一线科学家,以及分布在包括中国、美国、丹麦、挪威、新加坡、澳大利亚等多个国家的数十所大学及科研机构的联合实验室资源,致力于为学员提供高端STEM进阶学术项目与精英培养计划。 力求培养中国少年的科学精神,为中国乃至全球科技人才储备力量。